Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAAF4Q8WXU2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms