Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms