Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC110Q8TBZ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms