Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO3Q8TAP4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms