Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PJA1Q8NG27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PJA1Q8NG27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms