Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCPH1Q8NEM0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCPH1Q8NEM0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms