Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDPRQ8NCN5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms