Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA1Q8N8W4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA1Q8N8W4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms