Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms