Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms