Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC6Q8IVU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms