Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms