Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00523Q86TU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00523Q86TU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00523Q86TU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms