Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms