Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST9Q7L1S5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST9Q7L1S5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms