Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZD4Q76G19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms