Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q71RC1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q71RC1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q71RC1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q71RC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q71RC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q71RC1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q71RC1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q71RC1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q71RC1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q71RC1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms