Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXIP1Q6ZW49 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms