Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC6Q6W4X9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MUC6Q6W4X9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MUC6Q6W4X9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms