Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms