Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLPSL2Q6UWE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms