Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASC4Q6P4E1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms