Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIRMAQ69YN4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIRMAQ69YN4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIRMAQ69YN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms