Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms