Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms