Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms