Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO4Q5TGY1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms