Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEPDC1Q5TB30 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEPDC1Q5TB30 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEPDC1Q5TB30 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms