Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM74A1Q5RGS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM74A1Q5RGS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms