Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHC1Q5JVL4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms