Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CT47A1Q5JQC4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47A1Q5JQC4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms