Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC178Q5BJE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC178Q5BJE1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms