Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP55Q53EZ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms