Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRNQ4KMQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPRNQ4KMQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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