Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms