Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LETM2Q2VYF4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms