Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms