Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTC4SQ16873 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTC4SQ16873 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms