Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B3Q16720 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B3Q16720 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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