Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGCBQ16585 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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