Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ACKR1Q16570 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACKR1Q16570 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACKR1Q16570 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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