Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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