Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK3Q16288 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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