Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA2Q15560 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCEA2Q15560 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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