Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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