Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KARSQ15046 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KARSQ15046 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KARSQ15046 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KARSQ15046 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KARSQ15046 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KARSQ15046 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KARSQ15046 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KARSQ15046 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KARSQ15046 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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