Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF1Q14990 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF1Q14990 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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