Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRCAPQ14761 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms