Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF235Q14590 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF235Q14590 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms