Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIDRQ14159 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIDRQ14159 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIDRQ14159 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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