Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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